バックアップ対象としてフォルダを選択しても、選択したフォルダ内のファイルではなく、サブフォルダのみがバックアップされてしまいます。何か設定を見落としているのでしょうか？
いいえ。フォルダをバックアップすると、フォルダ内のサブファイルもバックアップされるはずです。弊社ではこの問題を再現できません。より詳細な情報をご提供いただけますでしょうか？フォルダの選択方法（およびどのフォルダか）を示すスクリーンショットを添付していただけると大変助かります。メールでお送りください support@drivehq.com
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